El sistema Intelligent Biomedic Organizations (IBO), fruto de un trabajo en el campo de la bioinformática en el que ha participado un investigador de la Universidad Politécnica de Madrid, facilita el análisis de datos procedentes de expresión genética.
Fuente: UPM.
Según cuenta la nota de prensa de la UPM, la aplicación de las tecnologías de la información a los entornos biomédicos ha adquirido una gran importancia durante los últimos años. Habitualmente el análisis de datos en bioinformática requiere de la realización de diferentes secuencias de acciones agrupadas en las etapas de pre-procesamiento, filtrado de información, agrupamiento y extracción del conocimiento o clasificación. Las acciones que se realizan en cada una de estas etapas son variadas y en el proceso de análisis de los datos hay que establecer las acciones y la secuencia en su aplicación. En este trabajo se plantea una arquitectura que permite analizar flujos de trabajo para el análisis de datos. En función de los resultados obtenidos en los flujos de datos, el sistema crea nuevos flujos que optimizan los resultados.
El núcleo del sistema incorpora estrategias de razonamiento basado en casos para la reorganización y planificación automática en función de análisis realizados con anterioridad. Básicamente, el sistema intenta simular el comportamiento de un humano: busca problemas similares al actual en una memoria de casos y recupera los más similares junto con las acciones aplicadas. A partir de las secuencias de acciones recuperadas y los resultados obtenidos crea una nueva secuencia de acciones que hay que aplicar sobre el nuevo problema. Posteriormente se evalúa la solución y se almacena el resultado obtenido para tenerlo en cuenta para futuros análisis.
El sistema incorpora diferentes técnicas de minería de datos, estadísticas y de inteligencia artificial que son aplicables como acciones en los flujos de análisis. El modelo organizativo se puede aplicar sobre diferentes tipos de datos que requieran cierta carga de procesamiento. Concretamente, la propuesta se probó sobre datos de bioinformática para la clasificación de pacientes a partir análisis genéticos, en particular pacientes con leucemias de varios tipos y con datos procedentes de tumores cerebrales. El sistema trata de simular el comportamiento del personal médico de laboratorio realizando las etapas pre-procesamiento, filtrado de información, agrupamiento y clasificación comentados anteriormente, de tal forma que el modelo selecciona las técnicas que hay que aplicar en las diferentes etapas y su secuencia, generando así flujos de análisis de los datos de modo automático que mejoran los resultados obtenidos en análisis previos realizados manualmente.
